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PBCV DNA連接酶

簡要描述:

PBCV DNA連接酶公司正在出售的產(chǎn)品:豚鼠心肌細胞 ALKB蛋白封閉多肽 諾氏梭狀芽孢桿菌PCR檢測試劑盒 大鼠嗜粒細胞趨化因子(ECF)ELISA試劑盒 肉毒堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移(CPT1)活性比色法檢測試劑盒 白色扁絲霉 致盲基因LCA5蛋白抗體

更新時間:2024-01-12

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PBCV DNA連接酶

公司產(chǎn)品僅供科研研究使用、不得用于臨床診斷!

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產(chǎn)品名稱

規(guī)格

A-PJ1093

PBCV DNA連接酶

1250U

A-PJ1093

PBCV DNA連接酶

5KU

描述: PBCV DNA 連 接酶 也稱為 SplintR 連接酶 或 Chorella 病毒 DNA 連接酶,它能夠高效催化相鄰的 DNA 核苷酸的連接,這個連接過程需要一條互補的 RNA 在兩條 DNA 單鏈間起“夾板"或“橋梁"的固定作用。PBCV DNA 連接 酶的這種活性遠遠優(yōu)于傳統(tǒng)的 T4 DNA 連接酶,有助于 miRNAs 和 mRNAs,包括 SNPs 在內(nèi)的研究方法的創(chuàng)新。 另外,在二代測序和分子診斷等眾多領(lǐng)域中,PBCV DNA 連接酶是富集目的基因的理想選擇。它具有穩(wěn)定的生物活 性,對 RNA 介導固定的 DNA 底物親和性強(米氏常數(shù) Km = 1 nM),能夠在復雜的混合物中檢測到亞納摩爾級的特 定 RNA。因此,在 RNA 檢測技術(shù)中,PBCV DNA 連接酶 不失為選擇用酶。
儲存:-20℃可保存 2 年。
10×PBCV Ligase Buffer:500 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM

MgCl2, 25 mM DTT, 5 mM ATP.
活性定義:25°C 反應 30 分鐘條件下,使 1pmol 的
DNA:RNA 雜交底物連接所需要的酶量定義為 1Unit。
反應溫度及失活該酶的最佳反應溫度為 25°C,可在 16-37°C 之間優(yōu)化,37℃可明顯提高反應的特異性;該酶在 65°C 加熱 20min 即可失活。
使用方法
1. 連接反應
連接底物(1 μM) 2 μl
10×PBCV Ligase Buffer 2 μl
PBCV DNA Ligase(25 U/μl) 1 μl
 滅菌水 up to 20 μl
25°C 反應 15-60min。
2. 65°C 加熱 20min,使酶失活。
注意事項
1.該酶對一價陽離子非常敏感,如 NaCl 或 KCl 的濃度應低于 50 mM。
2. 該酶的反應溫度為16~37°C,最佳溫度為25℃。
3. 連接效率隨著夾板 RNA 長度的減少而降低,當長度小于等于 10nt 時,連接效率為零。

6.png


PCR 反應需要使用哪些試劑和設備?

試劑:
模板DNA:PCR反應需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;引物:PCR反應的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;dNTPs:PCR反應中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成等生物學過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;Taq DNA聚合酶:PCR反應需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;PCR buffer溶液:對PCR反應具有緩沖作用,調(diào)節(jié)反應pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應特異性,從而提高反應效率;酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構(gòu)建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應產(chǎn)物;
設備:
PCR儀:用于控制反應溫度,保證PCR反應時不同溫度環(huán)節(jié)的嚴格控制;電泳槽:用于分離PCR擴增產(chǎn)物;核酸提取儀:從組織樣本中全自動提取核酸。  這些試劑和設備在PCR分子生物學技術(shù)中均是,只有在有序齊全的基礎(chǔ)上,才能進行PCR反應并得出準確結(jié)果。

5.pngPCR相關(guān)基礎(chǔ)實驗:

PCR反應基本步驟一般的聚合酶鏈式反應由20到35個循環(huán)組成,每個循環(huán)包括以下3個步驟:

一、變性:

利用高溫(93-98℃)使雙鏈DNA分離。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷。在第一個循環(huán)之前,通常加熱長一些時間以確保模板和引物分離,僅以單鏈形式存在。該步驟時間1-2分鐘,接下來PCR儀就控制溫度進入循環(huán)階段。

二、退火或稱接合,復性:

在DNA雙鏈分離后,降低溫度使得引物可以結(jié)合于單鏈DNA上。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導致引物不與模板結(jié)合或者錯誤地結(jié)合。該步驟時間1-2分鐘。

三、延伸:

DNA聚合酶由降溫時結(jié)合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度。傳統(tǒng)的Taq估計合成1000bp/min、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒、商業(yè)公司生產(chǎn)的融合型聚合酶僅需約10-15秒。

PCR反應條件優(yōu)化:

1、變性溫度和時間:

保證模板DNA解鏈是保證整個PCR擴增成功的關(guān)鍵。加熱90~95°C, 30~60s,再復雜的DNA 分子也可變性為單鏈。溫度過高或高溫持續(xù)時間過長,可對Taq酶活性和dNTP分子造成損害。

2、復性溫度和時間:

PCR擴增特異性取決于復性過程中引物與模板的結(jié)合。復性溫度越高,產(chǎn)物特異性越高。復性溫度越低,產(chǎn)物特異性越低。需根據(jù)引物的Tm值具體設定。

3、延伸溫度和時間:

一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間。引物小于16個核苷酸時,過高的延伸溫度不利于引物與模板的結(jié)合,可以緩慢升溫到70~75°C。延伸反應時間,可根據(jù)待擴增片段的長度而定,小于1kb, 1min足夠;大于1kb需加長延伸時間。Taq酶可根據(jù)1kb/min增加時間。這里需要注意,延伸時間過長可能出現(xiàn)非特異擴增。因此需要設置恰到好處的延伸時間。

4、循環(huán)數(shù):

其他參數(shù)選定后,PCR循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度。理論上說20?25次循環(huán)后,PCR產(chǎn)物的積累即可達到最大值,實際操作中由于每步反應的產(chǎn)率不可能達到100%,因此不管模板濃度是多少,20~30次是比較合理的循環(huán)次數(shù)。循環(huán)次數(shù)越多,非特異擴增增加。

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